这部动画片发生在未来，宇宙战争不断导致大量外星人来到地球避难。黑衣人是一群监视外星人活动并防止他们危害地球的特殊组织，他们的成员K和J的任务就是追查未在地球登记的外星人。在一次调查中，K和J发现外星恐怖分子正在暗中策划刺杀另一星球的大使，这将引发宇宙大战。为了阻止这场危机，K和J必须找到并阻止这批恐怖分子。他们穿梭在各种奇形怪状的外星人中，一系列有趣的故事就此展开。这部动画片改编自1997年的科幻电影《黑衣人》，该电影改编自威尔·史密斯的同名漫画，经过巴里·索楠菲尔德和斯蒂文·斯皮尔伯格的改编，加上史密斯和汤米·李·琼斯的精彩表演，成为票房成功的作品。
